- Save View -
視点を記録します．
Save Viewでは最大９個まで視点（座標，レンダリング，色情報など）を記録できます．
またCTRLキー＋数字キー（１〜９）でも視点を記録できます．
- Load View -
記録された視点を呼び出します．
Load Viewの番号（１〜９）はSave Viewで保存した番号とそれぞれ対応しています．
また数字キー（１〜９）でも視点の呼び出しができます．
- Movie -
分子の動作を記述したスクリプトファイルを読み込み，再生します．
スクリプトファイルは単純なテキストファイル（.txt）です．
記述できるスクリプトは以下の通りです．
| LOAD | ["分子ファイル名"] |
| LOOP | [ループ回数] （０を指定すると無限ループになります） |
| LEND | （ループ終端） |
| # | [経過時間] （およそ、数値x100ms） |
| MOVE | [対象分子] [ON/OFF] |
| SEEN | [対象分子] [ON/OFF] |
| RENDER | [対象分子] [RENDER] [STICK SIZE] [BALL SIZE] |
| COLOR | [対象分子] [COLOR] [COLOR] |
| LABEL | [対象分子] [LABEL] [COLOR] |
| RIBBON | [対象分子] [RIBBON] [RIBBON SIZE] [COLOR] |
| TRACE | [対象分子] [ON/OFF] |
| STEREO | [ON/OFF] |
| ROTATION | [ON/OFF] [X ROTATION] [Y ROTATION] （-30 - 30） |
| NAVI | ["出力文字列"] |
| ZOOM | [拡大率] （70 - 250%） |
| ! | コメントアウト（１文字目のみ有効） |
スクリプト内の対象分子の書式は以下の通りです．
分子:残基:原子 のように指定します．
| * | 全分子 |
| 1 | 番号１の分子 |
| 1-3,5 | 番号１〜３の分子と番号５の分子 |
| 1:GUA_2 | 番号１の分子のGUA_2残基 |
| *:GUA | 全てのGUA残基 |
| *:2 | 全ての残基番号２の残基 |
| *:3-5,7-9 | 残基番号３〜５，７〜９の残基 |
| 2:ADE_3:C3' | 番号２の分子のADE_3のC3'原子 |
| *:*:P | 全てのP原子 |
| *:1:C* | 残基番号１の全てのC原子 |
| *:*:N*,O* | 全てのN原子とO原子 |
| *:3-20:P | 残基番号３から20までのP原子 |
また，スクリプト内の各オプションを以下に示します．
| RENDER | |
| [RENDER] | Wireframe Stick BallandStick Spacefill Dot OFF |
| [STICK SIZE] | Normal Big Bigger Biggest Smallest Smaller Small |
| [BALL SIZE] | Normal Big Bigger Biggest Smallest Smaller Small |
| COLOR | |
| [COLOR] | Group Molecule Atom |
| [COLOR] | White Red Green Blue Yellow Purple SkyBlue LightGreen Pink Orange Gley |
| LABEL | |
| [LABEL] | OFF Atom Group Molecule |
| [COLOR] | White Red Green Blue Yellow Purple SkyBlue LightGreen Pink Orange Gley |
| RIBBON | |
| [RIBBON] | OFF Line Wireframe Helix |
| [RIBBON SIZE] | Normal Big Bigger Biggest Smallest Smaller Small |
| [COLOR] | Molecule White Red Green Blue Yellow Purple SkyBlue LightGreen Pink Orange Gley |
具体的な記述方法に関しては，以下のサンプルファイルを参考にしてみてください．